学校的指导思想是让每个学生尽快改善原有的基础上，尊重个人和鼓励个性发展，鼓励有才华和多方位多渠道学习。学校教学从实际出发，因材施教，对学习基础较好的学生进行有针对性的培养，对学习基础薄弱的学生，教师一视同仁，根据学生情况，加大辅导力度，使学生的学习成绩在原有基础上有较大提高。学校小学部确立了“一切为了学生，为了一切学生”的办学宗旨，提出了“突出双基、培养能力、发展个性、提高素质”的16字办学方针，致力于建设素质教育基地，努力培养德智体美劳五育并举，学有特长，全面发展的好学生。
学科专业 设有临床医学、口腔医学、护理学、中医学、医学影像学、麻醉学、预防医学、生物技术、药学、应用心理学、医学检验、眼视光学、康复治疗学、特殊教育、听力与言语康复学、生物制药、制药工程、假肢矫形工程、中药学等30个本科专业。是山东省博士学位授予立项建设单位，拥有硕士学位授权一级学科6个、二级学科39个，硕士专业学位授权点5个。有国家特色专业4个，山东省高水平应用型立项建设专业群4个、省级特色专业8个；省部级重点学科8个，其中临床医学学科进入ESI全球排名前1%，护理学、基础医学进入“软科中国最好学科排名”前50%。有国家中医药管理局重点研究室1个，省级重点实验室5个、省级人文社科基地1个、省级高校协同创新中心2个、省级医药卫生重点实验室9个，直属附属医院有省级临床重点专科21个。有省级精品课程（双语教学示范课程）32门，省级实验教学示范中心3个，省级人才培养模式创新实验区1个。
科学研究 近5年，承担科研课题1536项，其中国家自然科学基金课题102项（含重点项目2项），省部级课题251项；科技成果获省部级奖励17项，其中一等奖3项、二等奖8项；承担省级教学改革项目31项，获省级教学成果奖9项、研究生教育省级教学成果奖4项、省级优秀教材奖4项；出版专著275部、教材488部；发表论文2447篇，其中被SCI等收录和转载601篇，核心期刊929篇；获专利188项，其中发明专利85项。主办《中国医院统计》和中国学术期刊综合评价数据库来源期刊《滨州医学院学报》，均向国内外公开发行。
师资队伍 现有教职医护员工6686人（含2所直属附属医院），其中专任教师1098人；教授（含具有正高级专业技术职务人员）203人，副教授（含具有副高级专业技术职务人员）492人；博士352人，硕士1649人；聘有院士5人；有国家“千人计划”2人、“长江学者”讲座教授1人，全国模范、优秀教师5人，教育部新世纪优秀人才3人，享受国务院特贴专家6人；“泰山学者”特聘专家（教授）15人，山东省有突出贡献的中青年专家4人、卫生系统杰出学科带头人（泰山医学家）和青年重点科技人才3人、高校重点学科（实验室）首席专家2人，省级教学名师8人、优秀教师（研究生指导教师）6人；全国黄大年式教师团队1个，省级教学团队5个，省级科研创新团队1个。
条件设施 现有烟台、滨州两个校区，占地1616.8亩，总建筑面积63.7万平方米；资产总值12.5亿元，教学科研仪器设备总值2.33亿元；图书馆藏书240万册；有直属附属医院2所、非直属附属医院19所、教学医院14所、实践教学基地140余所；教学实习用床位28000余张。滨州附属医院是山东省区域医疗中心，建筑面积18万平方米，资产总值15.4亿元，仪器设备总值4.8亿元，规划床位2招生0张。烟台附属医院建筑面积25.5万平方米，规划床位2200张。
交流合作 先后与美国阿拉巴马大学、英国西苏格兰大学、德国柏林夏洛蒂医科大学、法国斯特拉斯堡大学、瑞典国家生命科学中心、奥地利欧亚太平洋大学联盟、芬兰卡累利阿应用科技大学、加拿大多伦多大学、新西兰东部理工学院、日本学校法人育英馆、韩国岭南大学等40所高校和医疗机构，与首都医科大学、南京医科大学、华东师范大学等国内知名高校，与山东国际生物科技园、愉悦家纺、绿叶制药、渤海制药、荣昌制药等大型医药集团，建立了友好交流与合作关系，在人员交流、联合培养研究生、共建项目、科研攻关、协同创新等方面取得了较好成果。
