菏泽医学专科学校的教研教学的质量是非常好的，学校开设了省级的精品课程：药理学、生理学、诊断学、内科学、内科护理学、外科护理学、诊断学、生物化学、无机化学、有机化学、天然药物化学、药剂学、检验仪器分析、临床检验基础、微生物学检验、免疫学检验、生物化学检验、临床麻醉学、麻醉解剖学、麻醉生理学、麻醉药理学、麻醉设备学、外科学、妇产科学、儿科学、预防医学、基础护理学、护理心理学等近三十种；学校先后还与山东大学医学院、青岛大学医学院联合举办在职研究生进修班。
学校实验实训教学资源丰富。校内设有公共基础实验教学中心、机能学实验教学中心、形态学实验教学中心、临床技能实训中心、护理技能实训中心等15个，校内实践基地实训基地设备先进，功能齐全，管理科学规范，已达到国内先进水平。现有直属附属医院1所，直属康复养老护理中心1所，拥有非直属附属医院3所，校外实训基地总数达到116个。
学校开设临床医学、口腔医学、护理、助产、药学、药品经营与管理、医学检验技术、康复治疗技术、眼视光技术、中医康复技术、医学影像技术、保险、老年服务与管理、老年保健与管理等14个专业，其中临床医学专业被确定为首批全国职业院校健康服务类示范专业，临床医学专业和护理专业为中央财政支持重点建设专业，临床医学专业、护理专业、助产专业为省级特色专业，拥有临床医学专业、药学专业、护理专业三个省级教学团队，健康照护专业群（护理、助产、老年服务与管理）为省级品牌专业群，拥有药理学、生理学、诊断学、内科学、内科护理学、外科护理学等29门省级精品课程。基础护理学、人体生理学、药理学、病理学与病理生理学为省级精品资源共享课程。学校为中医康复技术专业教学指导方案开发牵头单位。
收费、退费标准及资助政策
第1条学费标准：执行《山东省物价局、山东省财政厅、山东省教育厅关于优化普通高校学费结构有关事宜的通知》(鲁价费发[2013]136号)。临床医学、口腔医学、护理、助产、药学、医学检验技术、医学影像技术、康复治疗技术、中医康复技术、眼视光技术、老年保健与管理等专业为5400元/学年;药品经营与管理、保险、老年服务与管理专业为4500元/学年。
学生退学退费标准按照《山东省人民政府办公厅关于印发山东省高等学校收费管理暂行办法的通知》(鲁政办发[2008]65号)相关规定执行。
第2条 学校建立了奖、贷、助、补、减(免)等完善的资助体系。根据国家和省教育厅有关文件精神，结合我校实际，设有国家奖、助学金，国家励志奖学金，省政府奖、助学金，校级奖、助学金。新生凭入学通知书可以申请办理生源地信用助学贷款。
