上海交通大学医学院是由教育部和卫生部及上海市人民政府共建的一所全日制公立医科类高等院校；也是同时选入211工程、985工程及双一流的的院校，这是在中国的各种高等院校中都是极少的。目前学院有重庆南路、闵行、南汇三个校区，共开设专院系23个，附属医院有14个。
临床医学专业
临床医学八年制（本博连读）
经教育部和国务院学位委员会批准，上海交通大学医学院于2005年8月开始试办八年制医学教育（医学博士学位）。八年制临床医学专业的办学原则是“八年一贯，整体优化，加强基础，注重临床，培养能力，提高素质”，目标是培养具有医学博士学位的高层次、高素质的医学人才。合格的临床医学八年制毕业生授予医学博士（M.D.）专业学位。
学校对学生实行八年一贯制的连续培养。为确保各阶段的培养质量，对由于各种原因不能适应学习者，实行分段的分流和淘汰制，但不设具体淘汰率。在公共基础课程阶段、本科培养阶段和研究生培养阶段分别设立出口，对不能达到学校规定的相应要求或本人不愿进入下一阶段学习的学生，将实行分流或淘汰。
根据学生的学习情况，予以转专业、本科毕业或结业；按学生实际达到的专业水平授予学士学位（或不授予学位）、授予硕士学位等。
基础课程 政治、体育、外语、高等数学、物理、化学、生物学、人体解剖学、组织胚胎学、医学遗传学、生理学、生物化学、病理解剖学、病理生理学、微生物学、寄生虫、药理学等。（理科基础学习阶段在上海交通大学本部学习）
专业课程 内科学、外科学、妇产科学、儿科学、传染病学、流行病学、眼科学、耳鼻喉科学、皮肤学、核医学、卫生学、中医学、康复医学、肿瘤医学、急救医学以及部分研究生课程。
口腔医学专业
七年制（本硕连读） 上海交通大学口腔医学院的前身是1招生2年初成立的震旦大学医学院牙医系。1952年，全国院系调整，原圣约翰大学医学院和同德医学院并入震旦大学医学院，成立上海第二医学院，牙医系则改为上海第二医学院口腔医学系，学制四年，为全国四大口腔医学院校之一。1964年口腔医学系由原广慈医院迁入九院，将上海市第九人民医院作为口腔医学系的教学医院。
1985年随上海第二医学院改为上海第二医科大学，口腔医学系改为口腔医学院，学制为五年。为适应我国改革开放的现代化建设需要，1988年批准招收七年制学生。2001年起医学院全部招收七年制医学生。
本专业为教育部特色专业，专业排名列第二位。
作为一级学科，交通大学口腔医学院整体实力强。已成为拥有口腔颌面外科学、口腔内科学、口腔修复学、口腔正畸学、口腔预防学、儿童口腔学、口腔综合学、口腔颅颌面种植学、口腔影像学为特色的具有综合竞争实力的口腔临床医学和口腔生理、口腔解剖、口腔临床免疫、口腔药理、口腔生物、口腔组织病理、口腔材料、口腔专业外语等口腔基础医学的大学科群体。
本学科点为博士学位授予点和博士后科研流动站，拥有上海市口腔医学研究所、上海市口腔医学重点实验室。
培养目标 培养德、智、体全面发展的，达到硕士水平的高级口腔医学人才。通过培养，具有良好的思想品德、较广泛社会科学知识、较宽厚的口腔医学基础、具有口腔医学二级学科的理论与技能，毕业后能够从事口腔医学的临床、预防、教学和科研工作。
基础课程 政治、体育、英语、高等数学、物理、化学、生物学、人体解剖学、组织胚胎学、生理学、生物化学、病理解剖学、病理生理学、微生物学、药理学等。
专业课程 口腔组织病理学、口腔解剖生理学、内科学、外科学、儿科学、眼科学、耳鼻喉科学、皮肤病学、口腔内科学、口腔颌面外科学、口腔修复学、口腔预防学、儿童牙科学、正畸学、口腔材料以及部分硕士研究生课程。
预防医学专业
五年制
培养目标 培养具有良好的政治素质和道德修养，扎实的基础医学、临床医学、预防医学的基本理论、基础知识和基本技能，有一定发展潜力的、具有创新精神和实践能力的，能从事疾病预防与控制、卫生监督、社区卫生服务以及预防医学研究工作的复合型公共卫生专业人才。基础课程 政治、体育、英语、高等数学、物理、化学、生理学、生物化学、病原生物学、免疫学、药理学、病理学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、传染病学等。专业课程 卫生统计学、流行病学、环境卫生学、职业卫生与职业医学、营养与食品卫生学、儿童少年卫生学、卫生毒理学、分析化学与仪器分析、健康教育学、卫生法学与卫生监督、社会医学与卫生事业管理学、社区卫生服务等。
